O Sistema de Arquivos da USP (SAUSP) atua de forma descentralizada, contanto, portanto, com a participação de seus órgãos setoriais (Comissões Setoriais).
De acordo com com o artigo 7º da Portaria GR 3989/2008, que altera a portaria de institucionalização do SAUSP:
Compete aos Órgãos Setoriais a responsabilidade pela gestão documental das respectivas Unidades e Órgãos, com as seguintes atribuições:
- cumprir e fazer cumprir as normas emanadas do Órgão Central;
- orientar as Unidades e Órgãos quanto à qualidade da produção, fluxo, avaliação, conservação, processamento técnico, recuperação e acessibilidade dos documentos;
- elaborar propostas e aplicar planos de classificação, tabelas de temporalidade e outros instrumentos de gestão, aprovados pelo Conselho Diretivo;
- acompanhar as alterações da estrutura organizacional e do funcionamento das respectivas Unidades e Órgãos, de modo a instruir as ações do SAUSP;
- manter atualizados seus dados cadastrais junto ao Órgão Central;
- controlar o recolhimento e prover o tratamento técnico dos documentos de guarda permanente, consoante orientação do Conselho Diretivo;
- apresentar ao Órgão Central propostas de revisão e aperfeiçoamento do SAUSP.
As Comissões Setoriais são atualizadas de 4 em 4 anos.